Ash mag dan denken dat hij alles heeft gezien met betrekking tot Pokémon, maar is hij er klaar voor om de confrontatie met de mysterieuze Darkrai aan te gaan in zijn laatste, te gekke avontuur? Terwijl onze avonturiers op weg zijn naar een Pokémonwedstrijd, komen ze door Alamos Town, waar de Tijd-Ruimte-Torens staan. Samen met Alice ontdekken Ash en zijn vrienden iets wat verschrikkelijke nachtmerries bij Pokémon en mensen veroorzaakt! Baron Alberto, een zwierige maar arrogante man, geeft onmiddellijk de schuld aan Darkrai. Alsof Darkrai de beschuldigen heeft gehoord, verschijnt hij plotseling en confronteert hij de helden! Wie is Darkrai? Is het een vriend, of een vijand? Wanneer de hemel boven Alamos Town open barst en Dialga en Palkia vanuit de spleten in een nieuwe gecreëerde dimensie tevoorschijn komen, veroorzaakt hun daaruit voorvloeiende gevecht een gat in de ruimte-tijd-continuïteit! Zullen Ash en zijn vrienden deze krachtmeting overleven en Darkrai’s ware aard leren kennen?