Boychoir vertelt het verhaal van de 11-jarige Stet (Garret Wareing), die zijn alleenstaande moeder verliest na een fataal auto ongeluk. Wanneer zijn vader, die totaal van hem vervreemd is, genoeg blijkt te hebben aan zijn‘eigen’ gezin, besluit de directrice Stet naar een muzikaal jongensinternaat in New Jersey te sturen. De gedreven koormeester Carvelle, een man van weinig, maar scherpe woorden, ontdekt een uniek talent in Stet en besluit hem onder zijn hoede te nemen. Hij helpt Stet bij het ontdekken en ontwikkelen van zijn liefde en aanleg voor muziek, waardoor hij uitgroeit tot een talent als nooit tevoren…